公共データベースを用いた大規模ウイルス検出について、bioRxivでプレプリントを公開しました。

Hidden viral sequences in public sequencing data and warning for future emerging diseases
Junna Kawasaki, Shohei Kojima, Keizo Tomonaga, Masayuki Horie
doi: 10.1101/2021.05.17.444395

本研究では公共データベースに存在する鳥類および哺乳類動物由来のRNA-seqデータを解析し、RNAウイルスを検出・解析しました。

ディープシークエンスは存在する核酸（DNAやRNA）を網羅的に検出する技術です。公共のデータベース（例えばNCBI SRA）には大量のディープシークエンスデータが登録されています。これらのデータの多くはウイルス検出用に取得されたものではありませんが、由来となる動物がウイルスに感染していた場合、シークエンスデータにウイルス由来の配列が含まれます。

本研究では鳥類および哺乳動物由来の46,000以上のRNA-seqデータを網羅的に解析し、大量のRNAウイルスを検出しました。本研究によって、公共データベースの再利用によるウイルス探索の有用性が示されました。